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使用教程丨SnapGene如何设置以标准 GenBank 格式导出的序列的格式?

发布时间:2023-03-08 08:58:51点击量:

打开首选项

单击SnapGene → 首选项(macOS) 或编辑 → 首选项(Windows 或 Linux),然后在边栏中选择“导出”。
为导出的 GenBank 序列设置 LOCUS 名称

使用“轨迹名称:”下拉菜单设置 GenBank 轨迹字段是否设置为“文件名”、“地图标签”或序列“别名”。
限制 LOCUS 名称长度

对于“严格”的 GenBank 格式,GenBank 文件的名称长度必须LOCUS为 16 个字符或更少。
取消选中“基因座名称长度:”选项以允许任何长度的基因座名称。或者,选中该选项并设置自定义 LOCUS 名称长度限制。
设置特征名称的导出方式

默认情况下,SnapGene 在导出为“GenBank-Standard”格式时会将特征名称导出为/label限定符。如果未选中此选项,功能名称将作为限定符导出/note。此选项不影响导出为“ GenBank - SnapGene ”或“GenBank - Vector NTI”格式。
设置非标准特征的导出方式

SnapGene 允许使用非标准(自定义)特征类型 
默认情况下,自定义特征类型(和关联的限定符)将原封不动地导出为所有 GenBank 格式。为了符合严格的 GenBank 格式,请选中“将自定义功能类型导出为 misc_feature”选项。导出时,这会将所有自定义功能转换为misc_feature格式。
 

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